במידע שהתקבל בפנייה של התנועה לטוהר המידות למשרד מבקר המדינה עולה כי משרד מבקר המדינה פנה למשרד היועץ המשפטי לממשלה(היועמ"ש) בבקשה לחקור את תיק "פרשת הצוללות". נכון לשורת אלה, משרד היועמ"ש לא החזיר תשובה למשרד המבקר. משרד היועמ"ש סירב להתייחס לנושא.
במסמך התשובה לפניית התנועה לטוהר המידות, יועץ בכיר למבקר המדינה כתב כי "בכוונת מבקר המדינה לבדוק את נושא הרכש של הצוללות והספינות", והסביר כי "נוכח חקירות שנערכו בנושא פנה מבקר המדינה ליועץ המשפטי לממשלה (יועמ"ש) בבקשה לדעת האם קיימת עדיין מניעה לבדוק הנושא". המכתב הסתיים כי משרד המבקר "ממתינים לתשובת היועץ המשפטי לממשלה בכתב".
נכון לכתיבת שורות אלה, משרד מבקר המדינה עדיין מחכה לתשובת משרד היועמ"ש. על פי פרסומים שונים, המשטרה המליצה להעמיד לדין תריסר מחשודי הפרשה. בין החשודים דוד שרן, ראש מטהו לשעבר של שר האנרגיה יובל שטייניץ ומזכיר קצא"א.
בד בבד, רה"מ נתניהו תמך בפומבי במועמדותו של שרן בפריימריז האחרונים במפלגת הליכוד. ממשרד מבקר המדינה נמסר כי "יש לנו הקפדה שגוף לא ידרוך על גוף אחר. כשהתמונה מהיועץ תהיה ברורה לנו נוכל לקבל החלטות ענייניות". מהתנועה לטוהר המידות נמסר כי לאור ההתפתחויות האחרונות מהפרסומים בתקשורת חקירה בנושא מצד המבקר נחוצה מאוד. היועץ המשפטי של התנועה, עו"ד יובל יועז, הוסיף כי "נכון ללפני שבועיים הוא (מבקר המדינה-א"ו) ממתין לאיתות מהיועמ"ש שלא מתנהלת חקירה פלילית בעניין".